《神魔之塔》以世界各地的神話、傳奇、童話作為卡片的參考範本。從遊戲中關卡主線故事、潛能解放故事及昇華故事及羈絆等，可見出不同召喚獸互相關連，亦為遊戲演化推進的一大關鍵。

遊戲有六種符石，分別為「水」、「火」、「木」、「光」、「暗」五種屬性符石以及「心」符石。除以特殊卡片作為隊長或開啟特殊技能之外，將符石以直排或橫排的方式連成3粒或以上即可消除。

消除屬性符石可使相應屬性的召喚獸作出攻擊，消除心符石則可以回復生命力，消除符石形成Combo可增加攻擊及回復。

消除5顆或以上的符石會自動產生一顆強化符石，該符石的倍率較一般符石高，並可攻破特殊敵技(如：強化盾)。

隊伍可透過隊伍技能或主動技能產生種族符石，該符石對該種族的倍率較一般符石高。

戰鬥時把隊伍欄中的成員向下拉，能觸發「角色符石」，等同 1 粒相應的符石，消除該符石，該角色將額外追打 1 次，並於下回合攻擊力減至 0。角色符石亦能觸發角色的羈絆加成

遊戲中也有公會系統，讓玩家一同建立、成長，除每日的例行性任務外，不定期有公會任務、魔神戰、迎擊戰等，同公會的人可在此貢獻公會。